Непонятное определение - "
как бы спотыкается". Может быть, просто фрагментация большая сказывается? Из-за этого (одна из причин) может воспроизведение рывками происходить (то - есть, то - затык, и потом снова "догоняет" и - есть)))
Рассинхрон "классический", если его так можно обозвать, проявлялся раньше в таком виде: в продолжительном видеофайле (например, длительностью 1 час), в сАмом начале видеофайла - звук и видео совпадают, а по мере воспроизведения и приближения к концу клипа - отрыв звука от картинки увеличивается...
Может быть, при подключении микрофона параметры записи звука выбраны неверно?
Хотя, не уверен, что различие частоты дискретизации может повлиять на настройки проекта в монтажке